肿瘤标记物有助于肿瘤的筛查、协助诊断和判断预后，但是它们的器官特异性和准确性又使得这个问题变得复杂。我们就按照人体从头到脚的解剖顺序来一一解说常见的肿瘤标记物。
垂体垂体瘤是一种具有神经内分泌功能的颅内常见肿瘤，因此它的临床表现和垂体瘤具体分泌的激素类型有关。
其涉及到的首选标记物是人生长激素（HGH）、促肾上腺皮质激素（ACTH）和催乳素，每一种内分泌激素都对应着不同的临床表现。
需要知道得是，垂体瘤大多为良性，一般采用内分泌或手术治疗，只有极少数的病人会得垂体腺癌，恶性程度高，容易远处转移。
甲状腺、甲状旁腺甲状腺癌是甲状腺最常见的恶性肿瘤，涉及到的首选肿瘤标记物有如下三种：甲状腺球蛋白（TG）、降钙素（CT）、癌胚抗原（CEA）。
TG虽然是甲状腺产生的特异性蛋白，但它对疾病病因诊断缺乏特异性，故而一般临床上不会用于分化型甲状腺癌的术前诊断，但它的变化情况却是判断肿瘤残存或复发的重要指标，可以用于检测分化型甲状腺癌术后的复发和转移。
甲状旁腺瘤临床比较少见，其主要涉及到CT、PTH等内分泌激素，甲状旁腺瘤也主要影响钙磷调节，出现骨质的疏松和血钙的升高。
甲状腺癌为恶性肿瘤，手术是基本治疗方法，TG、CT、CEA可用于术后的随访，检测肿瘤的残存和复发情况。甲状旁腺瘤虽然是一种良性内分泌肿瘤，但因其甲状旁腺功能亢进会对骨骼系统和泌尿系统（主要是泌尿系结石）有严重损害，所以其治疗原则上是手术切除。
头颈部区域头颈部恶性肿瘤首选的肿瘤标记物是鳞状细胞癌抗原（SCC）、CEA。
SCC的特异性很不错，是很有效的鳞癌标记物，而CEA属于广谱性肿瘤标记物，在早期其诊断作用不强。
食管食管癌涉及的肿瘤标记物有细胞角蛋白片段19（CYFRA21-1）、CEA、SCC、组织多肽特异性抗原（TPS）。
上述肿瘤标记物一般需要联合使用，可以提高中晚期食管癌的诊断、预后判断及监测随访观察的效果，但总体而言，对于食管癌的肿瘤标记物的诊断特别是早期诊断并不成熟。
肺对于原发性肺癌所涉及到的肿瘤标记物，美国临床生化委员会和欧洲肿瘤标记物专家组推荐有CEA、神经元特异性烯醇化酶（NSE）、CYFRA21-1、胃泌素释放肽前体（ProGRP）、SCC。
对于小细胞肺癌而言，NSE和ProGRP是理想的指标，而SCC、CEA、CYFRA21-1则有利于非小细胞肺癌的诊断。当然了，上述指标均具备随访价值，对判断复发或转移有意义。
胃胃癌在我国消化道肿瘤中非常常见，并且现在具有发病年轻化的趋势。
其涉及到的肿瘤标记物是糖类抗原72-4（CA72-4）、CEA、CA19-9、CA50，其中首选的是CA72-4，它对胃癌的敏感性较高，但是其它消化道肿瘤和卵巢癌时该指标亦可升高。
乳腺乳腺癌是严重威胁女性健康的一种恶性肿瘤，其涉及到的首选肿瘤标记物是CA15-3和CEA，此二者在乳腺癌中应用价值较高，他们的联合使用可以显著提高对肿瘤复发和转移的检测敏感度。
但是上述两个指标并不适合乳腺癌的筛查和诊断，因它们对局部病变敏感度低，且在某些良性病变中也可以出现。
胰腺胰腺癌的恶性程度很高，临床上常用的与胰腺癌相关的肿瘤标记物有CA19-9、CEA、CA，这三者中应用最广泛价值最高的就是CA19-9，因此，它也是胰腺癌首选的肿瘤标记物。
CA19-9可用于胰腺癌的辅助诊断、疗效检测和协助判断复发转移情况，未经治疗的胰腺癌CA19-9可逐步增高，其测定值通常和临床病程有较高的相关性。
需要注意得是，虽然CA19-9对胰腺癌来讲是首选肿瘤有标记物，但它也有局限性，即在胆道感染、炎性时可出现假阳性。另外，部分（大约在3%～7%）胰腺癌患者为Lewis抗原阴性血型结构，是不表达CA19-9的。
肝脏原发性肝癌的首选标记物当然是甲胎蛋白（AFP），其数值也用于对肝癌的临床诊断，且在早期筛查中扮演重要角色。
当AFP≥ug/L，排除活动性或慢性肝炎、肝硬化、睾丸或卵巢胚胎源性肿瘤以及怀孕等，即可达诊断标准。
此外，α-L-岩藻苷酶、异常凝血酶原也是常用的肝癌诊断分子标记物。
胆囊、胆道胆囊癌和胆管癌绝大多数为腺癌，侵袭力强，预后差，其涉及到的首选肿瘤标记物是CA19-9和CEA等。
特别是在胆管癌的诊断、随访和评估治疗效果方面，CA19-9有一定意义，据文献报道，其特异性为92.7%，敏感性为50%。此外，CA19-9和CEA也可用于病情监测。
结直肠结直肠癌相关的肿瘤标记物有CEA，CA19-9，有肝转移的还需查AFP，有卵巢转移的需要查CA。
肾脏很长一段时间内，一直没有发现肾癌特异的肿瘤标记物，后来人们认识到在正常肾组织中M2肾丙酮酸激酶（M2-PK）主要表达于远端肾小管，其对肾细胞癌具有较高的敏感性，被认为是有前途的一种肾癌标志物。
丙酮酸激酶是糖酵解途径关键酶，具有L、R、M1、M2几种同工酶。M2-PK是指M2型丙酮酸激酶。当细胞恶变时，M2同工酶表达上升会导致肿瘤细胞中M2-PK含量的增高，进而导致肿瘤细胞的生长和转移。
因此其首选的肿瘤标记物是M2-PK、组织多肽抗原（TPA），次选CEA。
肾上腺嗜铬细胞瘤/副神经节瘤（PPGL）首选的肿瘤标记物是肾上腺素类物质（血浆）、儿茶酚胺（尿）、嗜铬素蛋白A(CgA)，次选高香草酸（尿）、香草扁桃酸（尿）、NSE等。
CgA的血浆浓度可作为PPGL和术前MN（甲氧基肾上腺素）、3MT（3-甲氧基酪胺）水平正常患者功能活性的替代标志物。其具体临床意义是，在产生MN或3MT的肿瘤患者中,手术恢复后2～6周，出现MN或3MT水平明显升高可能提示存在肿瘤切除不完全或复发。
类癌这是一类起源于胃肠道德内分泌细胞的低度恶性肿瘤，其特点是，组织结构像癌，有恶变倾向，但很少发生转移，故此得名类癌，属少见病范畴。
其可分泌大量5-羟色胺等生物活性物质，会引起血管运动障碍、胃肠道症状等，统称为类癌综合征。
因此其首选标记物是5-羟色胺、5-羟吲哚乙酸（尿）。
卵巢卵巢癌首选的肿瘤标记物是CA和人附睾蛋白4（HE4），二者在卵巢上皮癌中有非常高的应用价值。
CA是最常用的卵巢肿瘤标记物，特别是浆液性卵巢癌的首选肿瘤标记物。有文献研究发现，CA在绝经人群的应用价值更高。
HE4的诊断特异度显著高于CA，而且有一个很大的优势——其水平不受月经周期和绝经状态的影响。
需要知道的是，临床上常用的ROMA指数是将CA和HE4结合的一个模型，它的具体数值取决于CA及HE4水平、激素、绝经状态。
当然了，与卵巢恶性生殖肿瘤有关的肿瘤标记物还有AFP、β-人绒毛膜促性腺素（β-hCG）、NSE、乳酸脱氢酶（LDH）、CA19-9等。
膀胱膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一，美国FDA批准的膀胱癌尿液标志物检查方法有核基质蛋白22（NMP22）、膀胱肿瘤抗原（BTA）、纤维蛋白原降解产物（FB/FDP）等。
上述标记物虽然灵敏度较高，但其特异度较低。
子宫子宫内膜癌目前其无特异敏感的标记物，可选择CA、CA19-9、CA等作为肿瘤标记物，上述指标对诊断和疾病的术后检测有一定参考价值。
前列腺前列腺癌首选肿瘤标记物是前列腺特异抗原（PSA）、游离PSA、前列腺癌基因3（PCA3）（尿）。
PSA对前列腺癌具有高度特异性，其正常值一般小于4ng/mL，但当PSA大于10ng/mL时对前列腺癌具有临床诊断的显著意义。
需要注意的是，良性前列腺增生和前列腺炎也会有PSA增高，这时候就需要行游离PSA检测。
睾丸睾丸癌为罕见癌症，其主要表现是睾丸里出现硬肿块，可增大、转移扩散，其涉及到的首选标记物有AFP、β-hCG、LDH、胎盘碱性磷酸酶等。
睾丸癌被认为是一种可治愈的恶性肿瘤，多数患者治疗后可长期生存。
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